Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD8P48556 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms