Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms