Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms