Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms