Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETFBP38117 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETFBP38117 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETFBP38117 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETFBP38117 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETFBP38117 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETFBP38117 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETFBP38117 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETFBP38117 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETFBP38117 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETFBP38117 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETFBP38117 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETFBP38117 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETFBP38117 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ETFBP38117 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETFBP38117 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETFBP38117 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETFBP38117 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ETFBP38117 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETFBP38117 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETFBP38117 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ETFBP38117 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETFBP38117 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETFBP38117 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETFBP38117 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ETFBP38117 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ETFBP38117 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETFBP38117 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETFBP38117 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ETFBP38117 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETFBP38117 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETFBP38117 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETFBP38117 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETFBP38117 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ETFBP38117 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETFBP38117 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETFBP38117 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETFBP38117 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETFBP38117 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETFBP38117 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETFBP38117 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETFBP38117 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETFBP38117 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETFBP38117 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETFBP38117 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETFBP38117 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ETFBP38117 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETFBP38117 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETFBP38117 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETFBP38117 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETFBP38117 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETFBP38117 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETFBP38117 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETFBP38117 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETFBP38117 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETFBP38117 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETFBP38117 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETFBP38117 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETFBP38117 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETFBP38117 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETFBP38117 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETFBP38117 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETFBP38117 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETFBP38117 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETFBP38117 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETFBP38117 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETFBP38117 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ETFBP38117 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms