Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP62P37198 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP62P37198 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP62P37198 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP62P37198 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP62P37198 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP62P37198 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP62P37198 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP62P37198 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP62P37198 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP62P37198 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP62P37198 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP62P37198 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP62P37198 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP62P37198 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP62P37198 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP62P37198 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP62P37198 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP62P37198 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP62P37198 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP62P37198 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP62P37198 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP62P37198 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP62P37198 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP62P37198 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP62P37198 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP62P37198 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP62P37198 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP62P37198 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP62P37198 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP62P37198 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP62P37198 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP62P37198 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP62P37198 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP62P37198 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP62P37198 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP62P37198 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP62P37198 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP62P37198 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP62P37198 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP62P37198 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP62P37198 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP62P37198 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP62P37198 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP62P37198 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP62P37198 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP62P37198 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP62P37198 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP62P37198 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP62P37198 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP62P37198 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP62P37198 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP62P37198 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP62P37198 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP62P37198 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP62P37198 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP62P37198 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP62P37198 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP62P37198 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP62P37198 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP62P37198 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP62P37198 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP62P37198 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP62P37198 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP62P37198 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP62P37198 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms