Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms