Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBL1P28749 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBL1P28749 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBL1P28749 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBL1P28749 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBL1P28749 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBL1P28749 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RBL1P28749 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBL1P28749 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBL1P28749 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBL1P28749 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBL1P28749 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBL1P28749 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RBL1P28749 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RBL1P28749 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RBL1P28749 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RBL1P28749 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBL1P28749 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms