Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNTFRP26992 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms