Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms