Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA4P25789 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms