Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GADD45AP24522 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 352.7 ms