Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms