Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
XPAP23025 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XPAP23025 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XPAP23025 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XPAP23025 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
XPAP23025 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XPAP23025 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
XPAP23025 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XPAP23025 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XPAP23025 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XPAP23025 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
XPAP23025 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XPAP23025 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XPAP23025 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XPAP23025 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XPAP23025 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XPAP23025 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
XPAP23025 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XPAP23025 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XPAP23025 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XPAP23025 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XPAP23025 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XPAP23025 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
XPAP23025 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.5
XPAP23025 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
XPAP23025 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XPAP23025 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XPAP23025 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XPAP23025 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XPAP23025 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XPAP23025 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XPAP23025 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
XPAP23025 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
XPAP23025 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
XPAP23025 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XPAP23025 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XPAP23025 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XPAP23025 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms