Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALB2P22676 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALB2P22676 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALB2P22676 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALB2P22676 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALB2P22676 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALB2P22676 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALB2P22676 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALB2P22676 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALB2P22676 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALB2P22676 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALB2P22676 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALB2P22676 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CALB2P22676 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALB2P22676 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALB2P22676 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALB2P22676 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALB2P22676 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALB2P22676 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALB2P22676 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALB2P22676 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CALB2P22676 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALB2P22676 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CALB2P22676 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALB2P22676 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALB2P22676 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALB2P22676 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALB2P22676 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALB2P22676 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CALB2P22676 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CALB2P22676 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CALB2P22676 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CALB2P22676 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CALB2P22676 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CALB2P22676 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CALB2P22676 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CALB2P22676 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALB2P22676 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALB2P22676 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms