Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD53P19397 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD53P19397 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms