Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PDE6GP18545 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PDE6GP18545 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PDE6GP18545 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PDE6GP18545 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PDE6GP18545 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PDE6GP18545 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PDE6GP18545 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PDE6GP18545 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PDE6GP18545 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PDE6GP18545 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PDE6GP18545 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PDE6GP18545 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PDE6GP18545 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PDE6GP18545 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PDE6GP18545 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PDE6GP18545 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PDE6GP18545 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PDE6GP18545 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PDE6GP18545 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PDE6GP18545 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PDE6GP18545 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PDE6GP18545 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PDE6GP18545 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PDE6GP18545 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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