Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC5A1P13866 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC5A1P13866 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC5A1P13866 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC5A1P13866 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC5A1P13866 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC5A1P13866 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC5A1P13866 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC5A1P13866 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC5A1P13866 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC5A1P13866 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC5A1P13866 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC5A1P13866 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC5A1P13866 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC5A1P13866 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC5A1P13866 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC5A1P13866 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC5A1P13866 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC5A1P13866 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC5A1P13866 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms