Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms