Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGBP11216 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGBP11216 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGBP11216 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGBP11216 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGBP11216 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGBP11216 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGBP11216 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGBP11216 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGBP11216 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGBP11216 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGBP11216 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGBP11216 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGBP11216 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGBP11216 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGBP11216 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGBP11216 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGBP11216 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGBP11216 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGBP11216 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGBP11216 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGBP11216 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGBP11216 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGBP11216 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PYGBP11216 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 AC135178.5-201ENST00000602597 674 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PYGBP11216 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 AL079304.1-201ENST00000554595 828 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PYGBP11216 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PYGBP11216 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PYGBP11216 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PYGBP11216 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PYGBP11216 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PYGBP11216 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms