Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms