Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RARBP10826 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RARBP10826 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RARBP10826 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RARBP10826 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RARBP10826 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RARBP10826 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RARBP10826 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RARBP10826 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RARBP10826 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RARBP10826 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RARBP10826 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RARBP10826 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RARBP10826 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RARBP10826 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RARBP10826 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RARBP10826 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RARBP10826 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RARBP10826 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RARBP10826 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RARBP10826 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RARBP10826 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RARBP10826 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RARBP10826 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RARBP10826 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RARBP10826 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RARBP10826 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RARBP10826 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RARBP10826 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RARBP10826 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RARBP10826 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RARBP10826 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RARBP10826 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RARBP10826 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RARBP10826 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RARBP10826 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RARBP10826 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RARBP10826 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RARBP10826 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RARBP10826 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RARBP10826 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RARBP10826 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RARBP10826 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RARBP10826 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RARBP10826 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RARBP10826 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RARBP10826 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RARBP10826 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RARBP10826 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RARBP10826 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RARBP10826 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RARBP10826 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RARBP10826 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RARBP10826 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RARBP10826 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RARBP10826 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RARBP10826 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RARBP10826 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RARBP10826 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RARBP10826 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RARBP10826 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RARBP10826 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RARBP10826 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RARBP10826 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RARBP10826 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RARBP10826 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RARBP10826 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RARBP10826 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RARBP10826 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RARBP10826 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RARBP10826 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RARBP10826 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RARBP10826 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RARBP10826 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RARBP10826 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RARBP10826 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RARBP10826 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RARBP10826 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RARBP10826 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RARBP10826 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RARBP10826 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RARBP10826 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RARBP10826 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RARBP10826 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RARBP10826 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RARBP10826 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RARBP10826 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RARBP10826 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RARBP10826 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RARBP10826 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RARBP10826 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RARBP10826 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RARBP10826 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RARBP10826 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RARBP10826 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RARBP10826 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RARBP10826 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RARBP10826 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RARBP10826 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RARBP10826 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms