Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX5BP10606 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX5BP10606 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX5BP10606 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX5BP10606 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX5BP10606 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX5BP10606 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX5BP10606 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX5BP10606 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX5BP10606 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX5BP10606 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX5BP10606 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX5BP10606 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX5BP10606 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX5BP10606 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX5BP10606 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX5BP10606 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX5BP10606 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX5BP10606 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX5BP10606 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX5BP10606 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX5BP10606 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX5BP10606 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX5BP10606 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX5BP10606 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COX5BP10606 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX5BP10606 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX5BP10606 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX5BP10606 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX5BP10606 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX5BP10606 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX5BP10606 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX5BP10606 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX5BP10606 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX5BP10606 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX5BP10606 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX5BP10606 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX5BP10606 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX5BP10606 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX5BP10606 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX5BP10606 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX5BP10606 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX5BP10606 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX5BP10606 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX5BP10606 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX5BP10606 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX5BP10606 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX5BP10606 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX5BP10606 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX5BP10606 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX5BP10606 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX5BP10606 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX5BP10606 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX5BP10606 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX5BP10606 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX5BP10606 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX5BP10606 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX5BP10606 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX5BP10606 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX5BP10606 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX5BP10606 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms