Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRFP10586 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
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