Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFMP07197 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFMP07197 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFMP07197 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFMP07197 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFMP07197 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFMP07197 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFMP07197 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFMP07197 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFMP07197 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFMP07197 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFMP07197 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFMP07197 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFMP07197 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFMP07197 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFMP07197 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFMP07197 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFMP07197 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFMP07197 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFMP07197 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFMP07197 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFMP07197 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFMP07197 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFMP07197 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFMP07197 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFMP07197 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFMP07197 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
NEFMP07197 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFMP07197 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFMP07197 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFMP07197 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFMP07197 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFMP07197 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFMP07197 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFMP07197 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFMP07197 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFMP07197 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFMP07197 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFMP07197 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFMP07197 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFMP07197 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFMP07197 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFMP07197 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFMP07197 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFMP07197 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFMP07197 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFMP07197 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFMP07197 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFMP07197 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFMP07197 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEFMP07197 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFMP07197 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEFMP07197 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEFMP07197 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFMP07197 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFMP07197 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEFMP07197 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFMP07197 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFMP07197 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NEFMP07197 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFMP07197 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEFMP07197 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NEFMP07197 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEFMP07197 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEFMP07197 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFMP07197 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFMP07197 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFMP07197 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFMP07197 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NEFMP07197 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEFMP07197 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEFMP07197 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFMP07197 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEFMP07197 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFMP07197 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFMP07197 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFMP07197 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFMP07197 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFMP07197 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFMP07197 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms