Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
F13BP05160 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
F13BP05160 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
F13BP05160 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
F13BP05160 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
F13BP05160 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
F13BP05160 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
F13BP05160 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
F13BP05160 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
F13BP05160 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
F13BP05160 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
F13BP05160 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
F13BP05160 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
F13BP05160 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
F13BP05160 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
F13BP05160 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
F13BP05160 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
F13BP05160 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
F13BP05160 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
F13BP05160 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
F13BP05160 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
F13BP05160 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
F13BP05160 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
F13BP05160 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
F13BP05160 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
F13BP05160 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
F13BP05160 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
F13BP05160 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
F13BP05160 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
F13BP05160 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F13BP05160 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13BP05160 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13BP05160 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13BP05160 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13BP05160 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13BP05160 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13BP05160 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13BP05160 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13BP05160 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13BP05160 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13BP05160 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13BP05160 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13BP05160 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13BP05160 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13BP05160 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13BP05160 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13BP05160 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13BP05160 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13BP05160 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13BP05160 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13BP05160 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13BP05160 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms