Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms