Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOA1P02647 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOA1P02647 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOA1P02647 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOA1P02647 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOA1P02647 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOA1P02647 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOA1P02647 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA1P02647 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA1P02647 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms