Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms