Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms