Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms