Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms