Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEBLO76041 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEBLO76041 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEBLO76041 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEBLO76041 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEBLO76041 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEBLO76041 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEBLO76041 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEBLO76041 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEBLO76041 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEBLO76041 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEBLO76041 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEBLO76041 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEBLO76041 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEBLO76041 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEBLO76041 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEBLO76041 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NEBLO76041 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NEBLO76041 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEBLO76041 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEBLO76041 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEBLO76041 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEBLO76041 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEBLO76041 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEBLO76041 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEBLO76041 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEBLO76041 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEBLO76041 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NEBLO76041 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEBLO76041 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEBLO76041 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEBLO76041 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms