Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KA4O75676 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KA4O75676 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KA4O75676 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KA4O75676 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms