Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms