Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNMO15061 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNMO15061 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNMO15061 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNMO15061 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNMO15061 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNMO15061 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNMO15061 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNMO15061 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNMO15061 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNMO15061 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNMO15061 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNMO15061 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNMO15061 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNMO15061 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNMO15061 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNMO15061 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNMO15061 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNMO15061 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNMO15061 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNMO15061 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNMO15061 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNMO15061 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNMO15061 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNMO15061 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNMO15061 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNMO15061 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNMO15061 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNMO15061 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNMO15061 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNMO15061 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNMO15061 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNMO15061 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNMO15061 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNMO15061 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNMO15061 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNMO15061 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNMO15061 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNMO15061 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNMO15061 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNMO15061 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNMO15061 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNMO15061 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNMO15061 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNMO15061 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNMO15061 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNMO15061 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNMO15061 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNMO15061 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNMO15061 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNMO15061 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNMO15061 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNMO15061 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNMO15061 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNMO15061 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNMO15061 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNMO15061 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNMO15061 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNMO15061 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNMO15061 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNMO15061 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNMO15061 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNMO15061 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNMO15061 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNMO15061 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNMO15061 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNMO15061 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNMO15061 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNMO15061 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNMO15061 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNMO15061 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNMO15061 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNMO15061 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNMO15061 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNMO15061 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNMO15061 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNMO15061 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNMO15061 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNMO15061 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNMO15061 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNMO15061 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNMO15061 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNMO15061 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNMO15061 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNMO15061 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNMO15061 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNMO15061 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNMO15061 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNMO15061 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNMO15061 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNMO15061 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNMO15061 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNMO15061 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNMO15061 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNMO15061 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNMO15061 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNMO15061 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNMO15061 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNMO15061 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNMO15061 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms