Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM6BO15054 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
KDM6BO15054 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM6BO15054 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM6BO15054 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM6BO15054 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM6BO15054 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KDM6BO15054 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM6BO15054 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM6BO15054 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM6BO15054 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM6BO15054 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM6BO15054 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM6BO15054 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM6BO15054 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM6BO15054 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM6BO15054 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM6BO15054 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM6BO15054 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM6BO15054 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM6BO15054 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM6BO15054 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM6BO15054 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KDM6BO15054 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM6BO15054 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM6BO15054 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM6BO15054 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KDM6BO15054 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KDM6BO15054 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM6BO15054 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM6BO15054 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms