Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F3O00716 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F3O00716 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F3O00716 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F3O00716 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F3O00716 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F3O00716 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F3O00716 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F3O00716 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F3O00716 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F3O00716 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F3O00716 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F3O00716 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F3O00716 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F3O00716 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F3O00716 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F3O00716 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F3O00716 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F3O00716 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F3O00716 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F3O00716 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F3O00716 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F3O00716 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F3O00716 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F3O00716 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F3O00716 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F3O00716 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F3O00716 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F3O00716 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F3O00716 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F3O00716 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F3O00716 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F3O00716 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F3O00716 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F3O00716 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F3O00716 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F3O00716 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F3O00716 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F3O00716 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms