Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms