Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms