Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms