Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CYSRT1A8MQ03 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CYSRT1A8MQ03 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms