Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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