Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms