Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms