Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2F5

ICE1, Little elongation complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE1Q9Y2F5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms