Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms