Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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USP18Q9UMW8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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USP18Q9UMW8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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USP18Q9UMW8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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USP18Q9UMW8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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USP18Q9UMW8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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USP18Q9UMW8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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USP18Q9UMW8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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USP18Q9UMW8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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