Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms