Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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